Почему это могло произойти
Потому что не бывает 100% надежного носителя информации. Сектора на жестких дисках размагничиваются или повреждаются физически, теряя способность хранить информацию. На CD\DVD-дисках можно легко поставить едва заметную царапинку, из-за которой потом не получится считать данные. У SSD-накопителей ячейки теряют свои заряды или вообще разрушаются, т.к. там все очень тонко сделано. Тем самым невозможно уже определить точную последовательность нулей и единиц. Увы... Просто SSD на данный момент является разумным компромиссом между скоростью, объемом и надежностью. По скорости он превосходит CD, DVD, HDD. По объему... Ну, тут у каждого критерии свои, но как по мне, объем в 100-200Гб является достаточным для любого человека: система, софт, плюс несколько любимых игрушек. Больший объем не нужен просто, да и дорого уже получается. Все-таки SSD активно делают лишь последние 5-7 лет. Это HDD больше полувека (!) штампуют, поэтому у них и объемы сейчас такие. А что касается надежности... Ну, знаете, SSD не умрет, если вы уроните его на пол. Даже в работающем состоянии. А для HDD это зачастую верная смерть.
избежать в дальнейшем
Не получится такого избежать. Сам принцип работы флэш-памяти не гарантирует вам, что данные всегда будут доступны и что они будут храниться в целости и сохранности. Впрочем, с другими носителями информации та же шляпа... Выход всегда был, есть и будет еще долго оставаться только один - резервное копирование.
ХР, будучи самостоятельно установленной, "прожила" на ноутбуке почти 4 года
Система тут вообще не причем. В моей практике и куда более серьезные сроки работы ОС встречались. На моем домашнем ПК систему за последние 8 лет я переустанавливал тоже всего несколько раз, причем всякий раз это были повреждения, не совместимые с жизнью ОС, скажем так. Все эти мифы о том, что Винда слетает, что Винду надо раз в год переустанавливать - именно что мифы. Наоборот, моя практика показала, что ОС Windows обладает приемлемой надежностью и если даже она умирает, то это всегда "внешние" причины (смерть накопителя, вирусы и т.д.).
Как это сделать,не угробив вторую ОС,которая пока работоспособна?
Ищите статьи в интернете, как поставить Windows + Linux и что нужно сделать, чтобы подружить их загрузчики. Сам я таким никогда не занимался.
Откуда скачать дистрибутив 7-ки не модифицированный
http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=4529698
Данные на втором жестком диске как-нибудь будут доступны или про них можно забыть?
Ничего вашему HDD не будет. Впрочем, на время установки ОС лучше его физически извлечь из ноутбука. А то мало ли чего вы там наворотите со своими экспериментами во время переустановки...